Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRNKL1Q9BZJ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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