Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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