Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDHR2Q9BYE9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDHR2Q9BYE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDHR2Q9BYE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDHR2Q9BYE9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms