Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYCP2Q9BX26 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP2Q9BX26 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SYCP2Q9BX26 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms