Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDCA7Q9BWT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms