Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RSG1Q9BU20 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms