Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDC1Q9BTX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms