Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCGF1Q9BSM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms