Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms