Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAAF1Q9BRP4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAAF1Q9BRP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms