Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF1Q9BQI6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms