Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms