Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF25Q9BQ70 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms