Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms