Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT1Q99943 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms