Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms