Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SORT1Q99523 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORT1Q99523 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms