Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHOX2BQ99453 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHOX2BQ99453 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms