Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SIN3AQ96ST3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms