Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms