Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UIMC1Q96RL1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UIMC1Q96RL1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms