Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms