Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNAQ96QF7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms