Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNGAP1Q96PV0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNGAP1Q96PV0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNGAP1Q96PV0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNGAP1Q96PV0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNGAP1Q96PV0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SYNGAP1Q96PV0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms