Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD27Q96NW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms