Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCLT1Q96NL6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms