Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms