Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YTHDC1Q96MU7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YTHDC1Q96MU7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms