Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms