Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC17Q96LX7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC17Q96LX7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms