Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EP400Q96L91 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EP400Q96L91 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EP400Q96L91 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EP400Q96L91 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms