Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPNS2Q96L46 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPNS2Q96L46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms