Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPZA3Q96KX2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms