Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPIP1Q96JH7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms