Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGSM3Q96HU1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM3Q96HU1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms