Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms