Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SGF29Q96ES7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SGF29Q96ES7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SGF29Q96ES7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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SGF29Q96ES7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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SGF29Q96ES7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGF29Q96ES7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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