Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms