Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYTL4Q96C24 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYTL4Q96C24 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms