Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX21Q969T3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX21Q969T3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX21Q969T3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms