Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKD2Q969F2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms