Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-CQ95604 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms