Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCC1Q92922 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCC1Q92922 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms