Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRUQ92729 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRUQ92729 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms