Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CSRNP3Q8WYN3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms