Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC01599Q8WXQ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01599Q8WXQ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms