Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC107Q8WV48 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms