Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL11Q8NHH1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL11Q8NHH1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL11Q8NHH1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL11Q8NHH1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL11Q8NHH1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL11Q8NHH1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL11Q8NHH1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms