Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIEQ8NEW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIEQ8NEW7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms