Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC112Q8NEF3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC112Q8NEF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.9 ms